比特幣自中本聰創建以來，已出現過幾次底層協議的修改，原始協議中硬分叉出了眾多全新項目。www.emoneybtc.com萊特幣、達世幣、比特幣現金、比特黃金等其他項目都脫胎於比特幣，並自稱是對比特幣的特殊改良。
就現狀而言，比特幣區塊鏈面臨著許多缺陷，而這些缺陷讓它遭受到了巨大批評。其實，中本聰本人從一開始就明確表示，他歡迎對比特幣區塊鏈進行更多探討，所以即便現在比特幣遭受大量批判，也不是一件奇怪的事情。這些公認的內在缺陷引來了眾多對立派的預測，他們認為，比特幣“幣圈老大”的地位很有可能會“不保”。
我們來數數比特幣的缺點，這就包括了以下幾點： 速度緩慢
與兩年前相比，比特幣區塊鏈如今的交易確認速度可謂差之千裡。交易延遲已成為比特幣區塊鏈的常態，時常令用戶感到沮喪。這一問題和價格高度波動一同被視為比特幣不適合交易的主要原因。
顯然，為了鼓勵大眾使用比特幣，交易的執行時間的貨幣價值不應與接收時間的價值產生偏差。現實並非如此，因為如今比特幣的交易長達數小時，有時甚至幾天才能確認。這一缺陷也產生了幾種觀點，諸如隔離驗證和導致比特幣現金誕生的硬分叉這樣的創新都基於比特幣網絡的低效而誕生。
交易費用高昂
交易費用高昂的問題已成為比特幣生態系統的一大“恐慌”因素。
有的時候，這些費用高到甚至可以用“荒唐”來形容。從技術上看，比特幣的交易費用是由交易次數和每單交易的規模決定的。然而，這些費用並非流入任何中央權威機構，而是歸礦工所有，作為確認交易的回饋。因此，交易投入越高就有越多工作要做，在市場波動加劇的時期，比如現在，礦工更傾向投入低的交易。而這意味著干更少的活，因此高投入的交易（通常更受投資者歡迎）需要支付更多交易費用來吸引礦工。
這些交易費用往往抵消了“點對點交易是更便宜的匯兌手段”的假設。
“類中心化”
比特幣區塊鏈是去中心化的平台（至少從設計上看來是這樣的）。然而，比特幣生態的近期結構表明，絕大部分的挖礦算力掌握在少數人手中。作為由共識規范的社區，這意味著掌控多數哈希算力的少數礦工會一直發號施令。許多人認為這給比特幣社區籠上了一層中心化的外衣，而比特幣運作已是名副其實的中心化。
比特幣即將經歷又一次硬分叉——“比特原子”
比特幣區塊鏈即將經歷又一次硬分叉，硬分叉由一個匿名團隊主導，聲稱將創建新的數字貨幣“比特原子”（Bitcoin Atom, 簡稱BCA)並維持中本聰的最初原則。
據選擇保持匿名的團隊領導人稱，為解決速度和交易成本的雙重問題，協議將實行主鏈和側鏈並行機制（例如閃電網絡和原子交換）。他提到盡管中心化是比特幣的一個不太明顯的缺陷，交易所暴露的比特幣日常交易風險足以引起業界關注。
“中心化的問題不太突出，但加密貨幣主要的價值轉移問題在於交易所。中心化的交易可能會遭遇黑客入侵、消失或被監管者關閉，而像以太三角洲這樣的去中心化交易所卻不交易比特幣，只交易ERC-20代幣。即便如此，他們仍可能被黑客攻擊”，他說。
比特原子團隊聲稱將在比特幣節點和底層協議層面加入交易功能，這樣除了系統本身沒有人能控制交易。
不同於之前的硬分叉，這份協議將結合基於舊比特幣代碼庫的工作量認證和股權認證。分叉在2018年1月24日至25日在區塊505888進行。